MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sinorhizobium fredii USDA 257 plasmid pUSDA257

Total Repeats: 41

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018197	CAAA	2	8	182	189	75 %	0 %	0 %	25 %	398356391
2	NC_018197	CG	3	6	260	265	0 %	0 %	50 %	50 %	398356391
3	NC_018197	CTTG	2	8	299	306	0 %	50 %	25 %	25 %	398356391
4	NC_018197	CCA	2	6	346	351	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	398356391
5	NC_018197	CAG	2	6	421	426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356391
6	NC_018197	GCA	2	6	447	452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356391
7	NC_018197	TCA	2	6	541	546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356391
8	NC_018197	TGG	2	6	547	552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398356391
9	NC_018197	ATG	2	6	622	627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398356391
10	NC_018197	TCC	2	6	655	660	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398356391
11	NC_018197	GA	3	6	680	685	50 %	0 %	50 %	0 %	398356391
12	NC_018197	GCT	2	6	690	695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356391
13	NC_018197	GTT	2	6	759	764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	398356391
14	NC_018197	CGC	2	6	765	770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356391
15	NC_018197	GACC	2	8	995	1002	25 %	0 %	25 %	50 %	398356392
16	NC_018197	GA	3	6	1020	1025	50 %	0 %	50 %	0 %	398356392
17	NC_018197	CTC	2	6	1034	1039	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398356392
18	NC_018197	GAT	2	6	1058	1063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398356392
19	NC_018197	CGA	2	6	1065	1070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356392
20	NC_018197	GC	3	6	1089	1094	0 %	0 %	50 %	50 %	398356392
21	NC_018197	GAG	2	6	1145	1150	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398356392
22	NC_018197	ATG	2	6	1302	1307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398356392
23	NC_018197	GCG	2	6	1890	1895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356393
24	NC_018197	CGG	2	6	1899	1904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356393
25	NC_018197	GTC	3	9	1927	1935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356393
26	NC_018197	CGT	2	6	1957	1962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356393
27	NC_018197	ACAAT	2	10	2035	2044	60 %	20 %	0 %	20 %	398356394
28	NC_018197	CTT	2	6	2045	2050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398356394
29	NC_018197	T	6	6	2060	2065	0 %	100 %	0 %	0 %	398356394
30	NC_018197	CGC	2	6	2071	2076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356394
31	NC_018197	GC	3	6	2088	2093	0 %	0 %	50 %	50 %	398356394
32	NC_018197	AAG	2	6	2094	2099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398356394
33	NC_018197	ACA	2	6	2211	2216	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	398356394
34	NC_018197	TCA	3	9	2277	2285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356394
35	NC_018197	CGG	2	6	2323	2328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356394
36	NC_018197	CG	3	6	2344	2349	0 %	0 %	50 %	50 %	398356394
37	NC_018197	CAT	2	6	2491	2496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356394
38	NC_018197	GC	3	6	2555	2560	0 %	0 %	50 %	50 %	398356394
39	NC_018197	GCA	3	9	2700	2708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356394
40	NC_018197	TGG	2	6	2755	2760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398356394
41	NC_018197	GAC	2	6	2780	2785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356394

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.